Em 1984 o Fundo Mundial da Vida Silvestre (WWF) designou a Floresta Atlântica como um dos hábitats mais ameaçados do mundo. Da mata original que se extendia do Rio Grande do Norte até o Rio Grande do Sul, restam somente ca. de 4% da cobertura original. Assim como a Floresta Atlântica, outros ecossistemas florestais estão fortemente ameaçados devido ao desmatamento como por exemplo, as matas de restinga e matas de galeria que ocorrem associadas a outros biomas brasileiros. Apesar destes hábitats possuírem uma alta diversidade de organismos e serem altamente ameaçados, a quantidade de pesquisadores gerando conhecimento sobre a diversidade de espécies, estrutura e processos que regem tais ambientes florestais é ainda insuficiente.
O sul da Bahia é considerado um dos hot spots para a conservação por abrigar alta diversidade, endemismo e devastação, atraindo assim, vários financiamentos para projetos de pesquisa que objetivem a geração de conhecimento sobre a diversidade e a conservação. Por ter uma proposta de abranger várias áreas do conhecimento, a Uesc pode oferecer a formação para alunos nas áreas de taxonomia, ecologia, fisiologia, genética e anatomia onde o tema central seja a biodiversidade e conservação de florestas tropicais.
A UESC está localizada em uma área geográfica chave e reúne várias condições que podem facilitar esta geração de conhecimento em áreas de floresta. Sua localização no sul da Bahia representa uma facilidade para acessar diferentes áreas de mata, preservadas ou não, sendo relativamente próximas a Ilhéus.
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